AQUILONIA została założona 9 marca 1915 r. przez 11 ziemian – studentów późniejszej SGGW. Nasilenie działań wojennych kazało jeszcze tego samego roku zaprzestać działalności i zaangażować się w walkę zbrojną o długo wyczekiwaną niepodległość.
Po wojnie polsko-bolszewickiej 11 studentów założyło nową Aquilonię 4 listopada 1921 r. Kilka lat później dokonano scalenia obydwu organizacji, czego pozostałością są barwy błękitno-białe noszone przez oldermana.
Kolejnym momentem, kiedy Aquiloni po raz kolejny musieli zaświadczyć daniną krwi swą miłość do Ojczyzny był rok 1939. Korporacja zawiesiła działalność a członkowie wstępowali do wojska (AK i NSZ). Wielu z nich nie przeżyło wojny, część musiała uchodzić za granicę; niemal wszyscy byli później represjonowani przez okupanta sowieckiego, ale każdy sprostał wyzwaniu rzuconemu przez Honor.
5 listopada 1996 r. ostatnich 11 filistrów Aquilonii wyraziło zgodę na przyjęcie nowego pokolenia comilitonów, czym przywrócili ją do życia po upadku komuny. Tak trwa do następnego czasu próby.